1. Instituto Nacional de Pediatría
2. INP
3. Artículos

Título :	A Boolean network model of the FA - BRCA pathway
Creador:	Rodríguez A
Nivel de acceso:	Open access
Palabras clave :	Proteína BRCA1 - metabolismo Neoplasias de la Mama - genética Neoplasias de la Mama - metabolismo Ciclo Celular Células Cultivadas Daño del ADN Reparación del ADN Anemia de Fanconi - genética Anemia de Fanconi - metabolismo Proteínas del Grupo de Complementación de la Anemia de Fanconi - metabolismo Inestabilidad Genómica Humanos Modelos Biológicos BRCA1 protein; Fanconi anemia protein; article; biological model; breast tumor; cell culture; cell cycle; DNA damage; DNA repair; Fanconi anemia; genetics; genomic instability; human; metabolism; BRCA1 Protein; Breast Neoplasms; Cell Cycle; Cells, Cultured; DNA Damage; DNA Repair; Fanconi Anemia; Fanconi Anemia Complementation Group Proteins; Genomic Instability; Humans; Models, Biological Anemia de Fanconi Inestabilidad cromosomica Mutaciones hereditarias Cáncer de mama Anemia of Fanconi Chromosome instability Hereditary mutations Breast cancer
Descripción :	MOTIVACIÓN: La anemia de Fanconi (FA) es un síndrome de inestabilidad cromosómica originado por mutaciones hereditarias que afectan la vía de la Anemia de Fanconi - Cáncer de Mama (FA - BRCA), que se compromete a la reparación de los enlaces intertrándares de ADN. La enfermedad muestra un aumento de las aberraciones cromosómicas espontáneas y la hipersensibilidad a los agentes que crean interstrand ADN entrecruzamiento. A pesar del daño del ADN, las células deficientes en FA - BRCA son capaces de progresar a lo largo del ciclo celular, probablemente debido a la actividad de vías alternativas de reparación del ADN, o debido a defectos en los puntos de control que controlan la integridad del ADN. RESULTADOS: Se propone un modelo de red booleana de la vía FA - BRCA, proteínas Checkpoint y algunas vías alternativas de reparación del ADN. Hasta donde sabemos, este es el modelo de red más grande que incorpora una vía de reparación del ADN. Nuestro modelo es capaz de simular el proceso de reparación de ICL mediada por la vía FA - BRCA, la activación de las proteínas Checkpoint observadas por el daño recurrente del ADN, así como la reparación de ADN de doble filamento rompe y aductos de ADN. Hemos generado una serie de simulaciones de mutantes, algunos de los cuales nunca han sido informados y, por tanto, constituyen predicciones sobre la función de la FA - BRCA vía. Finalmente, nuestro modelo sugiere vías alternativas de reparación del ADN que se activan cuando la vía FA - BRCA es defectuosa Motivation: Fanconi anemia (FA) is a chromosomal instability syndrome originated by inherited mutations that impair the Fanconi Anemia/Breast Cancer (FA/BRCA) pathway, which is committed to the repair of DNA interstrand cross-links (ICLs). The disease displays increased spontaneous chromosomal aberrations and hypersensitivity to agents that create DNA interstrand cross-links. In spite of DNA damage, FA/BRCA-deficient cells are able to progress throughout the cell cycle, probably due to the activity of alternative DNA repair pathways, or due to defects in the checkpoints that monitor DNA integrity. Results: We propose a Boolean network model of the FA/BRCA pathway, Checkpoint proteins and some alternative DNA repair pathways. To our knowledge, this is the largest network model incorporating a DNA repair pathway. Our model is able to simulate the ICL repair process mediated by the FA/BRCA pathway, the activation of Checkpoint proteins observed by recurrent DNA damage, as well as the repair of DNA double-strand breaks and DNA adducts. We generated a series of simulations for mutants, some of which have never been reported and thus constitute predictions about the function of the FA/BRCA pathway. Finally, our model suggests alternative DNA repair pathways that become active whenever the FA/BRCA pathway is defective. © The Author 2012. Published by Oxford University Press.
Colaborador(es) u otros Autores:	Sosa D Torres L Molina B Frías S Mendoza L
Fecha de publicación :	2012
Tipo de publicación:	Artículo
Formato:	pdf
Identificador del Recurso :	10.1093/bioinformatics/bts036
Fuente:	Bioinformatics 28(6):858 - 866
URI :	http://repositorio.pediatria.gob.mx:8180/handle/20.500.12103/1581
Idioma:	eng
Aparece en las colecciones:	Artículos

Los ítems de DSpace están protegidos por copyright, con todos los derechos reservados, a menos que se indique lo contrario.