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Título : External ear microRNA expression profiles during mouse development
Creador: Torres L
Nivel de acceso: Open access
Palabras clave : Animales
Biología Computacional
Oído Externo - crecimiento y desarrollo
Oído Externo - metabolismo
Embrión de Mamíferos - citología
Embrión de Mamíferos - metabolismo
Femenino
Perfilación de la Expresión Génica
Hibridación in Situ
Ratones
MicroARNs - genética
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
Organogénesis -genética
ARN Mensajero - genética
Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Animals
Computational Biology
Ear, External - growth & development
Ear, External -metabolism
Embryo, Mammalian - cytology
Embryo, Mammalian - metabolism
Female
Gene Expression Profiling
In Situ Hybridization
Mice
MicroRNAs - genetics
Oligonucleotide Array Sequence Analysis
Organogenesis - genetics
RNA, Messenger - genetics
Real-Time Polymerase Chain Reaction
Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
MiARN
pinnae
aurícula
microtia
GEO (GSE64945)
miRNA
pinnae
auricle
microtia
GEO (GSE64945)
Descripción : MicroRNAs (miRNAs) comprenden una clase de aproximadamente 22 nucleótidos reguladora no codificante ARNs que desempeñan varios roles en diversos procesos biológicos. Los informes recientes sugieren que El desarrollo embrionario en mamíferos se acompaña de cambios dinámicos en la expresión de miARN; Sin embargo, no hay información sobre el papel de los miARN en el desarrollo del oído externo. El objetivo de este estudio fue determinar la etapa específica de la expresión de miRNAs durante el ratón Desarrollo del oído externo con el fin de identificar miRNAs potencialmente implicados junto con su posible Objetivos. MiRNA perfiles de expresión de los ratones fetales ratones pinnae y la espalda a 13,5 dpc Y 14,5 dpc se obtuvieron utilizando un array Affymetrix GeneChip miRNA 3,0. Triplicados biológicos Para ambos tejidos, cada uno recogido de una camada promedio de 16 fetos, fueron analizados. Los resultados fueron Se analizó con el software Transcriptome Analysis Console de Affymetrix para identificar MiRNAs. Se observó expresión diferencial de 40 miRNAs incluyendo algunos predichos a Genes implicados en el desarrollo del oído externo, como mmu-miR-10a, un miARN conocido por
MicroRNAs (miRNAs) comprise a class of approximately 22 nucleotide regulatory non-coding RNAs that play several roles in diverse biological processes. Recent reports suggest that embryonic development in mammals is accompanied by dynamic changes in miRNA expression; however, there is no information regarding the role of miRNAs in the development of the external ear. The aim of this study was to determine the stage-specific expression of miRNAs during mouse external ear development in order to identify potentially implicated miRNAs along with their possible targets. miRNA expression profiles from fetal mice pinnae and back skin tissues at 13.5 dpc and 14.5 dpc were obtained using an Affymetrix GeneChip miRNA 3.0 array. Biological triplicates for both tissues, each collected from a litter averaging 16 fetuses, were analyzed. The results were analyzed with Affymetrix’s Transcriptome Analysis Console software to identify differentially expressed miRNAs. We observed differential expression of 40 miRNAs including some predicted to target genes implicated in external ear development, such as mmu-miR-10a, an miRNA known to modulate Hoxa1 mRNA levels, and mmu-miR-200c and mmu-miR-205. To our knowledge, this is the first miRNA expression profiling study of external ear development in mammals. These data could set the basis to understand the implications of miRNAs in normal external ear development. © 2015 UBC Press.
Colaborador(es) u otros Autores: Juárez U
García L
Miranda-Ríos J
Frias S.
Fecha de publicación : 2015
Tipo de publicación: Artículo
Formato: pdf
Identificador del Recurso : 10.1387/ijdb.150124sf
Fuente: International Journal of Developmental Biology 59(10--12):497 - 503
URI : http://repositorio.pediatria.gob.mx:8180/handle/20.500.12103/2426
Idioma: eng
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