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http://repositorio.pediatria.gob.mx:8180/handle/20.500.12103/2946
Título : | Validating the systematic position of Plationus Segers, Murugan & Dumont, 1993 (Rotifera: Brachionidae) using sequences of the large subunit of the nuclear ribosomal DNA and of cytochrome C oxidase |
Creador: | Reyna Fabian, Miriam Erandi |
Nivel de acceso: | Open access |
Palabras clave : | Animales Zooplancton - clasificación Zooplancton - ultraestructura Rotíferos - genética Filogenia Animals Zooplankton - classification Zooplankton - ultrastructure Rotifera - genetics Phylogeny Plationus Cox1 LSU Filogenia de máxima verosimilitud Plationus Cox1 LSU Maximum likelihood Phylogeny |
Descripción : | "Son miembros de la familia Brachionidae
organismos libre-que viven que varían en tamaño desde 170 aa
250 micras. Forman parte del zooplancton
en los sistemas de agua dulce y marinos en todo el mundo.
Morfológicamente, se caracterizan los miembros de la familia
por un sola pieza tachuelados cuerpo sin
surcos, surcos, surcos o protectores de cabeza dorsales y un
malleate trophi. Las diferencias en estas estructuras han
sido tradicionalmente utilizado para reconocer 217 especies que
se clasifican en siete géneros. Sin embargo, la validez
de las especies, Plationus patulus, p. patulus macracanthus
Polyacanthus p. y p. felicitas han sido
confundir porque fueron asignados alternativamente en
Brachionus o Platyias, al considerar sólo
caracteres morfológicos y ecológicos. Basado en
imágenes de microscopio electrónico (SEM) de la
trophi, estos taxa fueron asignados a un nuevo género,
Plationus. En este estudio, examinamos la sistemática
posición de p. patulus y p. patulus macracanthus
utilizando secuencias de ADN de dos genes: el citocromo
subunidad de oxidasa 1 (cox1) y dominios D2 y D3 de
la subunidad grande del ARN ribosómico nuclear
(LSU). Además, las secuencias de la cox1 y LSU
que representan a cinco géneros de Brachionidae (Anuraeopsis,
Brachionus, Keratella, Plationus y Platyias) además de
cuatro especies de tres familias del orden Ploima
fueron utilizados como el outgroup. La máxima verosimilitud
(ML) los análisis se realizaron para cada individuo
¿gen, así como para la combinada (cox1? Datos LSU)
conjunto. El árbol de ML desde el conjunto combinado de datos rindió
la familia Brachionidae como un grupo monofilético
con bootstrap débil apoyo (\50%). Cinco principales
clados en este árbol tenían soporte de arranque alto ([85%).
El primer grupo estaba compuesto de tres poblaciones de
¿P. patulus? P. patulus macracanthus. El segundo
clado fue compuesto de una sola especie de Platyias.
El tercer grupo estaba compuesto por seis especies de
Brachionus. El clade IV incluyó un solo
especies del género Anuraeopsis y el quinto
clado fue compuesto de tres especies del género
Keratella. La divergencia genética entre Plationus
y Platyias oscilaron entre 18,4 y 19,2% para la cox1, y
de 4,5 a 4,9% de LSU y entre Brachionus
y Plationus, oscilaron entre 16,9 y 23.1% (cox1),
y de 7,3 a 9,1% (LSU). Morfológica
evidencia, la cantidad de divergencia genética, la
Dirección editor: K. Martens
M. E. Reyna-Fabia´n J. p. Laclette
Departamento de Inmunología, Instituto de Biomedicina
Investigación, Universidad Nacional Auto´noma de México,
04510 México, D.F., México
M. P. Cummings
Centro de Bioinformática y biología computacional,
Universidad de Maryland, College Park, MD 20742, Estados UNIDOS
M. Garcı´a-Varela (&)
Departamento de Zoología, Instituto de biología, Universidad
Nacional Auto´noma de México, 04510 México, D.F.,
México
correo electrónico: garciav@servidor.unam.mx
123
Clegg (2010) 644:361 – 370
DOI 10.1007 - s10750-010-0203-1
posición sistemática de Plationus dentro de la familia
Brachionidae y la posición de Plationus como una hermana
Grupo de Brachionus y Platyias apoyan la validez
de Plationus patulus y p. patulus macracanthus
en el género Plationus." Members of the family Brachionidae are free-living organisms that range in size from 170 to 250 microns. They comprise part of the zooplankton in freshwater and marine systems worldwide. Morphologically, members of the family are characterized by a single piece loricated body without furrows, grooves, sulci or dorsal head shields, and a malleate trophi. Differences in these structures have been traditionally used to recognize 217 species that are classified into seven genera. However, the validity of the species, Plationus patulus, P. patulus macracanthus P. polyacanthus, and P. felicitas have been confused because they were alternatively assigned in Brachionus or Platyias, when considering only morphological and ecological characters. Based on scanning electron microscope (SEM) images of the trophi, these taxa were assigned in a new genus, Plationus. In this study, we examined the systematic position of P. patulus and P. patulus macracanthus using DNA sequences of two genes: the cytochrome oxidase subunit 1 (cox1) and domains D2 and D3 of the large subunit of the nuclear ribosomal RNA (LSU). In addition, the cox1 and LSU sequences representing five genera of Brachionidae (Anuraeopsis, Brachionus, Keratella, Plationus, and Platyias) plus four species of three families from the order Ploima were used as the outgroup. The maximum likelihood (ML) analyses were conducted for each individual gene as well as for the combined (cox1 ? LSU) data set. The ML tree from the combined data set yielded the family Brachionidae as a monophyletic group with weak bootstrap support (\50%). Five main clades in this tree had high ([85%) bootstrap support. The first clade was composed of three populations of P. patulus ?P. patulus macracanthus. The second clade was composed of a single species of Platyias. The third clade was composed of six species of Brachionus. The fourth clade included a single species of the genus Anuraeopsis, and the fifth clade was composed of three species of the genus Keratella. The genetic divergence between Plationus and Platyias ranged from 18.4 to 19.2% for cox1, and from 4.5 to 4.9% for LSU, and between Brachionus and Plationus, it ranged from 16.9 to 23.1% (cox1), and from 7.3 to 9.1% (LSU). Morphological evidence, the amount of genetic divergence, the Handling editor: K. Martens M. E. Reyna-Fabia´n J. P. Laclette Department of Immunology, Institute for Biomedical Research, Universidad Nacional Auto´noma de Mexico, 04510 Mexico, D.F., Mexico M. P. Cummings Center for Bioinformatics and Computational Biology, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA M. Garcı´a-Varela (&) Department of Zoology, Institute of Biology, Universidad Nacional Auto´noma de Mexico, 04510 Mexico, D.F., Mexico e-mail: garciav@servidor.unam.mx 123 Hydrobiologia (2010) 644:361–370 DOI 10.1007 - s10750-010-0203-1 systematic position of Plationus within the family Brachionidae, and the position of Plationus as a sister group of Brachionus and Platyias support the validity of Plationus patulus and P. patulus macracanthus into the genus Plationus. |
Colaborador(es) u otros Autores: | Juan Pedro Laclette Michael P. Cummings Martın Garcıa Varela |
Fecha de publicación : | 2010 |
Tipo de publicación: | Artículo |
Formato: | |
Identificador del Recurso : | DOI: 10.1007/s10750-010-0203-1 |
Fuente: | Hydrobiologia 644(1):361-370 |
URI : | http://repositorio.pediatria.gob.mx:8180/handle/20.500.12103/2946 |
Idioma: | eng |
Aparece en las colecciones: | Artículos |
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